复日 FR-985 DNA序列自动判读系统

系统简介

系统可配合Sanger 法人工测序,将X光片上的电泳图谱完整读
入计算机内,
由Smart Sequence软件对其进行分析,绘出吸收峰曲
线及虚拟电泳图谱,
以灵活、科学的方式完成序列判读和分析。用
户无须配置昂贵的自动测序仪
,便可获得与 PE377完全兼容的分析
报告。

系统构成

高档品牌PC工作站
反射/透射介质扫描仪
EPSON Stylus Color打印机
Smart Sequence分析软件

基本功能

Smart Sequence是由复日科技针对DNA测序( Sanger双脱氧链
终止法) 实验而设计开发的一种生物图像分析软件
。其主要是与复
日 FR—985 DNA序列自动判读系统配套
,同时也可配合复日FR—980
生物电泳图像分析系统一起使用

Smart Sequence 中的基本功能可大致分为系统管理、图像获
取、图像处理、图像管理、DNA 测序、附加工具等几个部分
。其中
对 DNA序列的测定和分析是本软件的核心功能
。而其他功能基本与
Smart View 保持兼容。

Smart Sequence 提供了标准 TWAIN图像输入接口。可通过透
光扫描仪获得大幅面 X光胶片上的电泳图像
,还能方便地得到幻灯
片、照相正片或负片上的高解析度图像。

电泳图像是 Smart Sequence软件的分析对象,这些图像可永
久地以文件形式存放于硬盘或软盘中
、同时软件还向用户提供了一
组灵活的图像增强工具和实用的实验图像管理程序
。 Smart
Sequence可将单独的电泳图像或多种分析报表在高清晰度彩色打印
机上进行打印输出

作为核心、Smart Sequence 提供了一套完整、灵活且广泛适
用的 DNA序列判读方案
,可完全取代传统的人工读序、且不需要昂
贵的自动测序仪。
同时可将所测得的序列输出成通用的GCG、FASTA
等格式、并可对其进行必要的分析
,如:序列反转、3 读框显示、
启始码/结束码的识别、
翻译蛋白质序列等。



典型操作

对拍摄有电泳图像的 X光片进行扫描,将图像数字化后输入
计算机。

使用软件,分别对一组样品中的A、 T、 C、 G 四个泳道进
行扫描,将扫描数据存入内存缓冲区

根据缓冲区中的扫描数据进行序列判读,并可绘制、打印吸
收峰曲线或虚拟电泳图解。

对所测得的序列进行必要的分析,如:识别启始码/结束码
翻译成蛋白质序列等。