复日 G-LIMS 基因科研信息系统

生命科学代表着现代科技的未来,G-LIMS是
由复日科技依靠其雄厚的软件开发力量及计算机
系统集成经验,针对大规模基因测序研究而设计
的—套完整的生物实验信息系统。该系统的运行

可贯穿质粒抽提、PCR 反应、测序、数据分析等整个基因开发研
究过程。系统以计算机网络为基础,并可充分结合和联接基因科
研中的各种仪器设备及计算机软硬件、如:PE377 自动测序仪、
复日 FR-980电泳图像分析系统等。系统采用先进的 Intranet结
构,使其软件可成功跨越 PC、Mscitosh、 Sun、SGI等多种计算
机平台,并可接人Internet以充分利用更多的外部资源。系统从
功能上大体可以分为

Mumrod70.gif (121 bytes) 基因科研数据模块(Gene Research Data System)
Mumrod70.gif (121 bytes) 管理调度信息模块(Management Information System)
Mumrod70.gif (121 bytes) 公告板模块(Message System)
Mumrod70.gif (121 bytes) 公共信息服务模块(Public lnformation Service)
Mumrod70.gif (121 bytes) 基因数据库数据交换模块(Gene Database Exchange)


G-LIMS的主要功能

建立克隆管理数据库,从质粒抽提、 PCR反应、测序、到数
据分跟踪整个实验过程,统—存储和管理其间所产生的大量实验
数据

Mumrod70.gif (121 bytes)系统可自动或协助用户生成反应上样计划。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统可以与 ABI PRISM互相交互传送数据。在测序前自动生成
Sample Sheet,测序后导出测序结果表。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统可解决一次反应96个样品和—次测序不足96个样品所引起
的上样个数不相等的麻烦。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统可对已完成的测序或反应实验结果进行统计,查找出失败
样品的测序和相关反应信息,协助分析失败原因,制订重测计
划。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统可管理由GDS(如:复日FR—980或其它产品)所拍摄的质粒
的电泳凝胶图像。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统可对引物的设计、合成、接收进行有效的管理。
Mumrod70.gif (121 bytes)所有实验数据相互关联,系统自动建立和更新基因实验状况汇
总表,跟踪反映整个科研工程进展。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统提供完善的基因数据查询管理工具,更可作为基因数据库
的有效查询入口。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统提供一组图形化的序列分析工具,如:读框显示、启始码
/结束码识别、翻译蛋白质序列等。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统可配合大量的第三方基因分析软件资源(如:GCG、NCBI等),
定制接收和导出各种格式的文件报告。
Mumrod70.gif (121 bytes)配合科研,对整个机构的项目经费、人员、仪器设备、实验消
耗品、专利申报等进行统一管理。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统提供了可跨越平台的电子公告板系统,以协调各工作组用
户之间的工作。方便相互交换信息。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统通过公共信息服务模块与外部网络连接。以 Web方式通过
Internet向公众发布消息,建立永久可供外界访问的公共信息
服务站点,以充分利用本单位的信息和计算资源。

G-LIMS的主要特点

Mumrod70.gif (121 bytes)采用 SQL服务器结构建立LIMS数据库,更易扩展和与外部数据
库进行数据交换。
Mumrod70.gif (121 bytes)用户权限按工作组进行管理,系统设计高度强调网络安全性和
数据的保密性。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统大量支持Internet/Intranet资源。如:FTP、HTTP等。建
立在 Web上的应用程序可方便跨越 Sun、Mac、PC等多种计算机
平台。
Mumrod70.gif (121 bytes)用户可随时随地通过本系统动态获得整个工程的各项科研数据
及信息。且LIMS可与基因数据库构成关联。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统可充分结合现有的实际设备,做到对仪器设备和计算机网
络资源的最大利用率。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统对PC或各种UNIX机器都有比较好的支持,具有Windows95
/NTClient和Web Client二种用户端程序。
Mumrod70.gif (121 bytes)系统可对大量(超过数百G 的)基因数据进行灵活、安全的成批
转移和备份,并可对存储于其他介质(光盘、磁带、MO等)上的
数据进行方便地查询。

G-LIMS的系统结构

Mumrod70.gif (121 bytes) 连接到G-LIMS的系统结构图